第六届磁共振数据处理提高班
发布时间：2018-10-22 11:41:50 来源: 北京赛博尔医药科技有限公司
第六届磁共振数据处理提高班
北京赛博尔医药科技有限公司将于2018年3月31日-- 2018年4月4日(周五-下周三)举办第六届磁共振数据处理提高班（详见课表安排），欢迎大家前来报名咨询。
培训班依然坚持小班教学，手把手带教的教学模式，争取使每一位参加培训的学员能够在磁共振高级数据处理方法上取得进步。
1、培训简介
大脑是人体最重要同时也是最复杂的系统之一，脑成像已成为当今国际热门的科学研究领域。多模态（结构、弥散、静息态/任务态功能）磁共振成像技术被广泛用于研究各种认知过程以及各类神经精神疾病（例如：抑郁症、精神分裂症、阿尔茨海默症等）的脑机制。
当前，很多实验室以及国际公开数据平台都发布了大量的多模态影像数据集。使用FSL进行功能磁共振数据处理具有简单方便、易于批处理、容易多模态融合的特点。使用弥散磁共振成像数据，可以获得反映大脑白质变化的指标；并且可以构建脑解剖网络，使用图论方法对解剖网络进行研究，可以从系统的角度探究脑疾病对大脑白质连接的影响。此外，就分析方法而言，当前机器学习方法已广泛应用于影像数据分析，该方法可以结合影像数据构建预测模型，用于预测某一个被试是否是患者，或者纵向预测某个患者服药后未来的改善；而且，相比于传统的单变量分析方法，该方法是一种多元模式分析方法，对提取组间差异可能有更高的敏感性。
值得注意的是，该类研究属于典型的多学科高度交叉的新兴学科，需要研究者具备多个学科的基础背景知识，其具体实现则涉及诸多计算步骤，过程相对繁琐，为部分研究者开展相关工作造成了一定困扰。基于此，我们拟举办磁共振数据处理提高班，教授学员们这些先进的技术手段（脑网络分析、多元模式分析等）的理论和应用前沿，以及使用流程化软件（如：FSL、PANDA、PRoNTo）实现以上分析。
2、培训对象
本次提高班的培训对象是具有一定多模态磁共振成像数据处理理论和实践基础的临床医生（如放射科、精神科、神经内外科、康复科、儿科等与脑健康相关科室），心理、生物医学、临床类在读研究生及其他相关领域的学者。针对的培训对象已具备必要的脑功能，结构数据处理基础知识。
同时，为了保证教学效果，使学员充分掌握培训班所教授的数据处理技术，培训班实行小范围的理论与实践相结合，授课、操作、指导及问题解决一体化。培训内容主要包括脑任务态磁共振成像数据分析、弥散磁共振数据处理及相关软件PANDA（http://www.nitrc.org/projects/panda）、脑网络分析及相关软件Gretna（http://www.nitrc.org/projects/gretna）、BrainNet Viewer（http://www.nitrc.org/projects/bnv）、多元模式分析及相关软件PRoNTo（http://www.mlnl.cs.ucl.ac.uk/pronto/prtsoftware.html）等，详细内容见课表安排。
3、培训课程安排
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时间 |
课程名 |
主要内容 |
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第一天 3月31日 何清华
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上午 |
Linux简介和fMRI数据准备 |
1、Linux和Terminal命令回顾 2、用DCM2NII转换格式 3、调整MRI数据的存储和显示方向 4、用BET剥掉非脑组织 5、fsl和fslview软件演示 |
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下午 |
FSL数据预处理FSL个体分析
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1、fMRI实验设计回顾 2、fMRI数据Onset的准备 3、用FSL进行数据预处理 3、用FSL进行个体数据分析 |
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第二天 4月1何清华 |
上午 |
FSL数据分析结果查看与ICA数据分析 |
1、查看FSL个体数据分析结果 2、Melodic功能介绍 3、用Melodic去噪 4、用Melodic进行ICA分析 |
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下午 |
FSL数据组分析 FSL数据批处理 |
1、FSL进行组分析的基本原理 2、FSL进行组分析的模型构建 3、查看FSL组分析结果 4、用fslmeants进行ROI分析 5、FSL数据批处理 |
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第三天 4月2日 舒妮 |
上午 |
弥散磁共振成像（diffusion MRI，dMRI）的原理、数据分析流程及应用研究 |
1、dMRI原理简介 2、dMRI数据处理流程：弥散指标计算 1）体素水平分析 2）图谱水平分析 3）TBSS水平分析 4）相关应用研究 3、dMRI数据处理流程：脑解剖网络构建 |
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下午 |
弥散磁共振成像分析软件包PANDA详解及上机操作 |
使用PANDA完成上述处理： 1、体素水平分析 2、图谱水平分析 3、TBSS水平分析 4、脑解剖网络构建 |
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第四天 4月3日 宋素涛
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上午 |
基于机器学习的多体元模式分析技术介绍 |
1、GLM vs. MVPA 2、MVPA 对任务态数据进行解码的流程与工作原理简介 3、MVPA方法在脑影像研究中的应用 4、fMRI数据准备与上机操作 |
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下午 |
MVPA软件包介绍与上机操作 |
1、LibSVM详解与上机操作：二分类与多分类 2、交叉验证方法的实现 3、PRoNTo toolbox 简介与上机操作：分类与回归 |
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第五天 4月4日 舒妮 |
上午 |
脑网络基本概念 |
1. 图论度量 2. 脑网络构建 |
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下午 |
脑网络分析软件包Gretna详解及上机操作 |
1、使用Gretna软件计算常用脑网络图论度量 2、使用Gretna软件进行网络度量的统计分析 3、使用Gretna软件作图 |
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4、培训人数
为保证培训质量，此次培训限定人数20人左右，报名敬请从速。
5、培训地点
北京市经济技术开发区科创十三街18号院锋创科技园5号楼3A层3A01，具体见会议指南。
6、培训费用
所有参会人员3000/人（含资料费、培训费和午餐费，交通及住宿费自理）。
7、报名方式
请将报名回执发送至：Cibr_medical@163.com
8、缴费方式
银行转账或者支付宝（账号：13381109780 户名：杨南），不接受现场缴费，谢绝录像，主办方提供发票。
9、联系方式
杨老师13381109780
杨老师17718449506
姜老师15904965265
报名回执表
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单位名称 （发票抬头，纳税人识别号） |
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姓名 |
性别 |
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电话号码 |
科室/专业 |
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缴费方式 |
□转帐 □支付宝 （请选择在□打√） |
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银行信息 |
户名：北京赛博尔医药科技有限公司 账号：0200048409200117652 |
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汇款备注 |
第六届磁共振数据处理提高班 |
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注：请完整填写回执表后回传给我们，以便给你发送确认函，谢谢支持！
11、在线支持服务
参加培训学员将得到在线技术支持服务，伴随参加培训班的学员共同成长。
12、培训人员简介：
何清华，男，博士，西南大学心理学部教授，硕士生导师，中国心理学会决策心理学专业委员会委员，美国南加州大学脑与创造力研究所博士后、访问学者，SSCI收录杂志Frontiers in Psychology（IF=2.32）和Frontiers in Psychiatry（IF=3.53）副主编。其研究主要采用基因技术、脑成像技术和脑刺激来考察人类决策功能的神经机制，并试图揭示成瘾伴随决策障碍的发病机制。以第一作者和合作者的形式在国内外高水平杂志上发表论文70余篇，总计被引次数800余次，H指数为15，H-10指数为26。其中，发表在神经科学领域顶级杂志The Journal of Neuroscience的第一作者论文受到多家国外权威科学新闻媒体的争相报道，包括BBC News、Scientific Daily等。多次受邀在UCLA、香港教育学院、中科院心理所、四川大学、北京中医药大学等地做报告。目前主持国家自然科学基金青年项目1项，并作为第一参与者参与国家自然科学基金面上项目2项，同时主持其他省部级研究课题多项。目前担任Biological Psychiatry、NeuroImage、Human Brain Mapping、Cortex、Neuropharmacology、Journal of Phonetics、Journal of Personality Disorders、Drug and Alcohol Dependence、《心理科学》等国内外著名杂志的审稿人。
宋素涛，博士，济南大学教育与心理科学学院副教授。主要关注领域为大脑状态解码研究与情感认知神经科学。研究基于fMRI 与 ERP 实验技术，结合机器学习、多变量模式分析等算法开展对任务态神经影像数据的分析，构建刺激信息的正向编码与反向解码模型，进而对视觉及情绪性刺激加工的神经机制进行解释。研究成果发表于 Journal of neuroscience methods, Frontiers in human neuroscience ，IEEE Transactions on Biomedical Engineering 等国际杂志。主持国家自然科学基金资助项目一项，参与国家自然科学基金项目多项。
舒妮，女，博士，北京师范大学脑与认知科学研究院副教授，博导，国际期刊PLoS ONE的学术编委，加拿大McGill大学访问学者。2004年在中国科学技术大学自动化系获得学士学位；2009年在中国科学院自动化研究所模式识别国家重点实验室获得博士学位；2009年8月进入北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室工作。主持和参与多项国家自然科学基金项目。目前主要从事基于扩散磁共振成像的人脑结构连接组的计算方法学及应用研究，以（共同）第一或通讯作者发表SCI论文19篇（影响因子6分以上的9篇，JCR Top论文9篇，封面文章2篇），如Journal of Neuroscience, Cerebral Cortex, Radiology, Human Brain Mapping等。发表论文的SCI总引用达到869次，第一或通讯作者论文的SCI引用516次，他人引用410次（其中包括Nature Review Neuroscience, Lancet Neurology, Annual Review of Clinical Psychology, Neuron等国际顶级期刊），主持了国自然青年基金和面上项目三项，作为研究骨干参与了科技部青年973。
