BrainVoyager QX是一款神经成像分析软件其功能如下：

数据管理功能，提供对数据的分层视图。

工作流工具能够指定、执行和记录所有受试者试验的完整分析。

快速和高度优化的2D和3D分析和可视化程序。

全面的预处理工具，包括头动校正，高通滤波和扫描时间层校正。

使用一般线性模型（GLM）对全脑和基于皮层的假设驱动做数据统计。

多因子设计和与外部（如行为）变量相关性的随机效应协方差分析。

多体素模式分析（MVPA）工具，包括支持向量机（SVMs）和递归特征消除（RFE）。

分布式的源脑电图（EEG）和脑磁图（MEG），同时测量与伪影的EEG-fMRI耦合分析。

弥散加权成像（DWI）结合了结构和功能MRI和可视化纤维束。

动态统计阈值使用FDR的方法进行多重比较校正。

团簇阈值大小为体积和表面积的多重比较校正。

利用人口感受野（PRF）估计值，以及传统的相位编码分析进行视网膜脑图分析。

对多个受试者大脑体积感兴趣区域和大脑表面感兴趣区域的分析。

全脑和基于数据驱动的分析使用了独立主成分分析（ICA），此分析能够进行单个和组分析。

皮层厚度作为高级形态学分析。

高分辨率3D解剖数据集的功能和弥散加权数据的自动配准。

一些用于大脑自动分割，表面重建，皮层膨胀和扁平化的高级方法。

受试者之间基于皮层的配准利用每个个体大脑沟/回模式与标准模板进行归一化的方式，如：alairach变换。

创建（“种子点”），EEG/ MEG多个偶极子模型的可视化与BESA 5程序相结合。

将整合后的全脑和皮层表面渲染得到的图像。

解剖和功能的可视化数据集基于实时GPU对全脑的渲染。

一个实时的导航模块作为TMS神经导航系统的一部分。

支持多核和多处理器和开放式架构，记录文件格式。

支持跨平台脚本，可以对多个受试者数据进行批处理。

支持跨平台的C++插件，使得BrainVoyager的功能更多。

Windows版本支持基于COM的接口，可访问所有主要的计算机语言（如C / C++，VB，java）以及MATLAB。

Mac OS X（64位）版本支持AppleScript脚本允许外部程序控制BrainVoyager从并将它与其他程序脚本的工作流程进行整合。